Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Szrd1Q6NXN1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Szrd1Q6NXN1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Szrd1Q6NXN1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Szrd1Q6NXN1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Szrd1Q6NXN1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Szrd1Q6NXN1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Szrd1Q6NXN1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Szrd1Q6NXN1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Szrd1Q6NXN1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Szrd1Q6NXN1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Szrd1Q6NXN1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Szrd1Q6NXN1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Szrd1Q6NXN1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Szrd1Q6NXN1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Szrd1Q6NXN1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Szrd1Q6NXN1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Szrd1Q6NXN1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Szrd1Q6NXN1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms