Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sp140Q6NSQ5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sp140Q6NSQ5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sp140Q6NSQ5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sp140Q6NSQ5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sp140Q6NSQ5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sp140Q6NSQ5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sp140Q6NSQ5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sp140Q6NSQ5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sp140Q6NSQ5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sp140Q6NSQ5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sp140Q6NSQ5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sp140Q6NSQ5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sp140Q6NSQ5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sp140Q6NSQ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sp140Q6NSQ5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sp140Q6NSQ5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sp140Q6NSQ5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sp140Q6NSQ5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sp140Q6NSQ5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sp140Q6NSQ5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sp140Q6NSQ5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sp140Q6NSQ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sp140Q6NSQ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sp140Q6NSQ5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sp140Q6NSQ5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sp140Q6NSQ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sp140Q6NSQ5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sp140Q6NSQ5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sp140Q6NSQ5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sp140Q6NSQ5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sp140Q6NSQ5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sp140Q6NSQ5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sp140Q6NSQ5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sp140Q6NSQ5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sp140Q6NSQ5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sp140Q6NSQ5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sp140Q6NSQ5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sp140Q6NSQ5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sp140Q6NSQ5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sp140Q6NSQ5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sp140Q6NSQ5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sp140Q6NSQ5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sp140Q6NSQ5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sp140Q6NSQ5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sp140Q6NSQ5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Sp140Q6NSQ5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sp140Q6NSQ5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sp140Q6NSQ5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Sp140Q6NSQ5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sp140Q6NSQ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sp140Q6NSQ5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sp140Q6NSQ5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sp140Q6NSQ5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sp140Q6NSQ5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sp140Q6NSQ5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sp140Q6NSQ5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sp140Q6NSQ5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sp140Q6NSQ5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sp140Q6NSQ5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sp140Q6NSQ5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sp140Q6NSQ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sp140Q6NSQ5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sp140Q6NSQ5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sp140Q6NSQ5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sp140Q6NSQ5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sp140Q6NSQ5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sp140Q6NSQ5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sp140Q6NSQ5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sp140Q6NSQ5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sp140Q6NSQ5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sp140Q6NSQ5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sp140Q6NSQ5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sp140Q6NSQ5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sp140Q6NSQ5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sp140Q6NSQ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sp140Q6NSQ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sp140Q6NSQ5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sp140Q6NSQ5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sp140Q6NSQ5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sp140Q6NSQ5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms