Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZX8

Ablim3, Actin-binding LIM protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ablim3Q69ZX8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ablim3Q69ZX8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ablim3Q69ZX8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ablim3Q69ZX8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ablim3Q69ZX8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ablim3Q69ZX8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ablim3Q69ZX8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ablim3Q69ZX8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ablim3Q69ZX8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ablim3Q69ZX8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ablim3Q69ZX8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ablim3Q69ZX8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ablim3Q69ZX8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ablim3Q69ZX8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ablim3Q69ZX8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ablim3Q69ZX8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ablim3Q69ZX8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ablim3Q69ZX8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ablim3Q69ZX8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ablim3Q69ZX8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ablim3Q69ZX8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ablim3Q69ZX8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ablim3Q69ZX8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ablim3Q69ZX8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ablim3Q69ZX8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ablim3Q69ZX8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ablim3Q69ZX8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ablim3Q69ZX8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ablim3Q69ZX8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ablim3Q69ZX8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ablim3Q69ZX8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ablim3Q69ZX8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ablim3Q69ZX8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ablim3Q69ZX8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ablim3Q69ZX8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ablim3Q69ZX8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ablim3Q69ZX8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ablim3Q69ZX8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ablim3Q69ZX8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ablim3Q69ZX8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ablim3Q69ZX8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ablim3Q69ZX8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ablim3Q69ZX8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ablim3Q69ZX8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ablim3Q69ZX8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ablim3Q69ZX8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ablim3Q69ZX8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ablim3Q69ZX8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ablim3Q69ZX8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ablim3Q69ZX8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ablim3Q69ZX8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ablim3Q69ZX8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ablim3Q69ZX8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ablim3Q69ZX8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ablim3Q69ZX8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ablim3Q69ZX8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ablim3Q69ZX8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ablim3Q69ZX8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ablim3Q69ZX8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ablim3Q69ZX8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ablim3Q69ZX8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ablim3Q69ZX8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ablim3Q69ZX8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ablim3Q69ZX8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ablim3Q69ZX8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ablim3Q69ZX8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ablim3Q69ZX8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ablim3Q69ZX8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ablim3Q69ZX8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ablim3Q69ZX8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ablim3Q69ZX8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ablim3Q69ZX8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ablim3Q69ZX8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ablim3Q69ZX8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ablim3Q69ZX8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ablim3Q69ZX8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ablim3Q69ZX8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ablim3Q69ZX8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ablim3Q69ZX8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ablim3Q69ZX8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ablim3Q69ZX8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ablim3Q69ZX8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ablim3Q69ZX8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms