Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CilpQ66K08 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CilpQ66K08 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CilpQ66K08 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CilpQ66K08 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CilpQ66K08 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CilpQ66K08 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CilpQ66K08 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CilpQ66K08 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CilpQ66K08 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CilpQ66K08 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CilpQ66K08 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CilpQ66K08 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CilpQ66K08 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CilpQ66K08 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CilpQ66K08 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CilpQ66K08 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CilpQ66K08 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CilpQ66K08 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CilpQ66K08 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CilpQ66K08 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CilpQ66K08 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CilpQ66K08 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CilpQ66K08 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CilpQ66K08 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CilpQ66K08 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CilpQ66K08 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CilpQ66K08 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CilpQ66K08 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CilpQ66K08 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CilpQ66K08 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CilpQ66K08 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CilpQ66K08 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CilpQ66K08 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CilpQ66K08 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CilpQ66K08 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CilpQ66K08 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CilpQ66K08 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CilpQ66K08 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CilpQ66K08 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CilpQ66K08 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CilpQ66K08 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CilpQ66K08 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CilpQ66K08 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CilpQ66K08 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CilpQ66K08 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CilpQ66K08 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CilpQ66K08 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CilpQ66K08 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CilpQ66K08 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CilpQ66K08 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CilpQ66K08 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CilpQ66K08 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CilpQ66K08 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CilpQ66K08 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CilpQ66K08 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CilpQ66K08 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CilpQ66K08 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CilpQ66K08 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CilpQ66K08 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CilpQ66K08 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CilpQ66K08 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CilpQ66K08 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CilpQ66K08 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CilpQ66K08 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CilpQ66K08 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CilpQ66K08 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CilpQ66K08 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CilpQ66K08 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CilpQ66K08 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CilpQ66K08 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CilpQ66K08 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CilpQ66K08 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CilpQ66K08 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CilpQ66K08 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CilpQ66K08 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CilpQ66K08 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CilpQ66K08 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CilpQ66K08 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CilpQ66K08 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CilpQ66K08 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CilpQ66K08 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CilpQ66K08 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CilpQ66K08 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms