Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ly6eQ64253 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ly6eQ64253 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ly6eQ64253 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ly6eQ64253 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ly6eQ64253 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ly6eQ64253 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ly6eQ64253 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ly6eQ64253 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ly6eQ64253 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ly6eQ64253 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ly6eQ64253 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ly6eQ64253 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ly6eQ64253 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ly6eQ64253 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ly6eQ64253 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly6eQ64253 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly6eQ64253 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly6eQ64253 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ly6eQ64253 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly6eQ64253 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly6eQ64253 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly6eQ64253 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly6eQ64253 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly6eQ64253 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly6eQ64253 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ly6eQ64253 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ly6eQ64253 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ly6eQ64253 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ly6eQ64253 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ly6eQ64253 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ly6eQ64253 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly6eQ64253 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ly6eQ64253 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ly6eQ64253 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ly6eQ64253 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly6eQ64253 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly6eQ64253 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly6eQ64253 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly6eQ64253 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly6eQ64253 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly6eQ64253 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly6eQ64253 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ly6eQ64253 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ly6eQ64253 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly6eQ64253 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly6eQ64253 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly6eQ64253 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly6eQ64253 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly6eQ64253 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6eQ64253 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6eQ64253 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6eQ64253 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6eQ64253 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly6eQ64253 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly6eQ64253 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ly6eQ64253 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ly6eQ64253 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms