Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Ccdc18Q640L5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
Ccdc18Q640L5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC40■■■■□ 3.99
Ccdc18Q640L5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
Ccdc18Q640L5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ccdc18Q640L5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ccdc18Q640L5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Ccdc18Q640L5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Ccdc18Q640L5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Ccdc18Q640L5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Ccdc18Q640L5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Ccdc18Q640L5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Ccdc18Q640L5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
Ccdc18Q640L5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Ccdc18Q640L5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
Ccdc18Q640L5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Ccdc18Q640L5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Ccdc18Q640L5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Ccdc18Q640L5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Ccdc18Q640L5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Ccdc18Q640L5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Ccdc18Q640L5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Ccdc18Q640L5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Ccdc18Q640L5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Ccdc18Q640L5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
Ccdc18Q640L5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Ccdc18Q640L5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
Ccdc18Q640L5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Ccdc18Q640L5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Ccdc18Q640L5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Ccdc18Q640L5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Ccdc18Q640L5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Ccdc18Q640L5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Ccdc18Q640L5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Ccdc18Q640L5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Ccdc18Q640L5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
Ccdc18Q640L5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Ccdc18Q640L5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Ccdc18Q640L5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Ccdc18Q640L5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Ccdc18Q640L5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Ccdc18Q640L5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Ccdc18Q640L5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Ccdc18Q640L5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Ccdc18Q640L5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Ccdc18Q640L5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
Ccdc18Q640L5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
Ccdc18Q640L5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Ccdc18Q640L5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Ccdc18Q640L5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Ccdc18Q640L5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Ccdc18Q640L5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
Ccdc18Q640L5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Ccdc18Q640L5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Ccdc18Q640L5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Ccdc18Q640L5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Ccdc18Q640L5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Ccdc18Q640L5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC39.63■■■■□ 3.94
Ccdc18Q640L5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC39.63■■■■□ 3.94
Ccdc18Q640L5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC39.63■■■■□ 3.94
Ccdc18Q640L5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Ccdc18Q640L5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
Ccdc18Q640L5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Ccdc18Q640L5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Ccdc18Q640L5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
Ccdc18Q640L5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Ccdc18Q640L5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Ccdc18Q640L5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Ccdc18Q640L5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Ccdc18Q640L5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Ccdc18Q640L5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Ccdc18Q640L5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Ccdc18Q640L5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Ccdc18Q640L5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Ccdc18Q640L5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Ccdc18Q640L5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Ccdc18Q640L5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Ccdc18Q640L5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ccdc18Q640L5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ccdc18Q640L5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ccdc18Q640L5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Ccdc18Q640L5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Ccdc18Q640L5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Ccdc18Q640L5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Ccdc18Q640L5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Ccdc18Q640L5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Ccdc18Q640L5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
Ccdc18Q640L5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Ccdc18Q640L5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Ccdc18Q640L5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Ccdc18Q640L5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Ccdc18Q640L5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Ccdc18Q640L5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Ccdc18Q640L5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Ccdc18Q640L5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Ccdc18Q640L5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Ccdc18Q640L5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Ccdc18Q640L5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
Ccdc18Q640L5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
Ccdc18Q640L5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
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