Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift52Q62559 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift52Q62559 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift52Q62559 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift52Q62559 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift52Q62559 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift52Q62559 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift52Q62559 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift52Q62559 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift52Q62559 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift52Q62559 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift52Q62559 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift52Q62559 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift52Q62559 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift52Q62559 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift52Q62559 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift52Q62559 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift52Q62559 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift52Q62559 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift52Q62559 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift52Q62559 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift52Q62559 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ift52Q62559 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ift52Q62559 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift52Q62559 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift52Q62559 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift52Q62559 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift52Q62559 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift52Q62559 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift52Q62559 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift52Q62559 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift52Q62559 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift52Q62559 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift52Q62559 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift52Q62559 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift52Q62559 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift52Q62559 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift52Q62559 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift52Q62559 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift52Q62559 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift52Q62559 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift52Q62559 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift52Q62559 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift52Q62559 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ift52Q62559 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift52Q62559 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift52Q62559 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift52Q62559 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift52Q62559 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ift52Q62559 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ift52Q62559 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift52Q62559 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift52Q62559 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift52Q62559 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift52Q62559 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift52Q62559 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift52Q62559 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift52Q62559 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift52Q62559 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift52Q62559 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift52Q62559 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift52Q62559 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift52Q62559 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift52Q62559 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift52Q62559 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift52Q62559 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift52Q62559 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift52Q62559 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ift52Q62559 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift52Q62559 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift52Q62559 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift52Q62559 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift52Q62559 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift52Q62559 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift52Q62559 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift52Q62559 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift52Q62559 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift52Q62559 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift52Q62559 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift52Q62559 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift52Q62559 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift52Q62559 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift52Q62559 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift52Q62559 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift52Q62559 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift52Q62559 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ift52Q62559 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift52Q62559 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift52Q62559 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift52Q62559 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift52Q62559 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift52Q62559 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift52Q62559 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift52Q62559 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ift52Q62559 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift52Q62559 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift52Q62559 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift52Q62559 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift52Q62559 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ift52Q62559 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms