Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3gl2Q62420 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3gl2Q62420 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3gl2Q62420 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3gl2Q62420 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3gl2Q62420 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3gl2Q62420 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3gl2Q62420 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3gl2Q62420 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3gl2Q62420 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3gl2Q62420 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3gl2Q62420 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh3gl2Q62420 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3gl2Q62420 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3gl2Q62420 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3gl2Q62420 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3gl2Q62420 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3gl2Q62420 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3gl2Q62420 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3gl2Q62420 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3gl2Q62420 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3gl2Q62420 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3gl2Q62420 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3gl2Q62420 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3gl2Q62420 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3gl2Q62420 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3gl2Q62420 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3gl2Q62420 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3gl2Q62420 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3gl2Q62420 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3gl2Q62420 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3gl2Q62420 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3gl2Q62420 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3gl2Q62420 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh3gl2Q62420 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3gl2Q62420 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3gl2Q62420 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3gl2Q62420 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3gl2Q62420 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3gl2Q62420 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3gl2Q62420 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3gl2Q62420 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3gl2Q62420 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3gl2Q62420 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3gl2Q62420 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3gl2Q62420 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3gl2Q62420 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3gl2Q62420 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3gl2Q62420 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sh3gl2Q62420 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3gl2Q62420 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3gl2Q62420 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3gl2Q62420 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3gl2Q62420 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.2 ms