Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sprr1bQ62267 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sprr1bQ62267 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sprr1bQ62267 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms