Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SnrpcQ62241 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SnrpcQ62241 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnrpcQ62241 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SnrpcQ62241 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SnrpcQ62241 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms