Protein–RNA interactions for Protein: Q62230

Siglec1, Sialoadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siglec1Q62230 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Siglec1Q62230 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Siglec1Q62230 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Siglec1Q62230 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Siglec1Q62230 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Siglec1Q62230 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Siglec1Q62230 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Siglec1Q62230 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Siglec1Q62230 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Siglec1Q62230 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Siglec1Q62230 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Siglec1Q62230 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Siglec1Q62230 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Siglec1Q62230 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Siglec1Q62230 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Siglec1Q62230 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Siglec1Q62230 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Siglec1Q62230 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Siglec1Q62230 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Siglec1Q62230 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Siglec1Q62230 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Siglec1Q62230 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Siglec1Q62230 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Siglec1Q62230 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Siglec1Q62230 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Siglec1Q62230 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Siglec1Q62230 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Siglec1Q62230 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Siglec1Q62230 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Siglec1Q62230 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Siglec1Q62230 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Siglec1Q62230 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Siglec1Q62230 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Siglec1Q62230 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Siglec1Q62230 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Siglec1Q62230 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Siglec1Q62230 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Siglec1Q62230 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Siglec1Q62230 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Siglec1Q62230 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Siglec1Q62230 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Siglec1Q62230 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Siglec1Q62230 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Siglec1Q62230 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Siglec1Q62230 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Siglec1Q62230 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Siglec1Q62230 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Siglec1Q62230 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Siglec1Q62230 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Siglec1Q62230 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Siglec1Q62230 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Siglec1Q62230 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Siglec1Q62230 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Siglec1Q62230 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Siglec1Q62230 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Siglec1Q62230 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Siglec1Q62230 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Siglec1Q62230 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Siglec1Q62230 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Siglec1Q62230 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Siglec1Q62230 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Siglec1Q62230 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Siglec1Q62230 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Siglec1Q62230 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Siglec1Q62230 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Siglec1Q62230 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Siglec1Q62230 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Siglec1Q62230 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Siglec1Q62230 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Siglec1Q62230 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Siglec1Q62230 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Siglec1Q62230 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Siglec1Q62230 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Siglec1Q62230 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Siglec1Q62230 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Siglec1Q62230 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Siglec1Q62230 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Siglec1Q62230 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Siglec1Q62230 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Siglec1Q62230 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Siglec1Q62230 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Siglec1Q62230 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Siglec1Q62230 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Siglec1Q62230 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Siglec1Q62230 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Siglec1Q62230 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Siglec1Q62230 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Siglec1Q62230 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Siglec1Q62230 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Siglec1Q62230 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Siglec1Q62230 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Siglec1Q62230 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Siglec1Q62230 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Siglec1Q62230 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Siglec1Q62230 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Siglec1Q62230 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Siglec1Q62230 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Siglec1Q62230 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Siglec1Q62230 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Siglec1Q62230 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms