Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssr4Q62186 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssr4Q62186 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ssr4Q62186 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssr4Q62186 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssr4Q62186 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssr4Q62186 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssr4Q62186 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssr4Q62186 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssr4Q62186 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssr4Q62186 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssr4Q62186 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssr4Q62186 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssr4Q62186 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssr4Q62186 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssr4Q62186 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssr4Q62186 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssr4Q62186 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssr4Q62186 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssr4Q62186 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssr4Q62186 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssr4Q62186 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssr4Q62186 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssr4Q62186 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssr4Q62186 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssr4Q62186 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssr4Q62186 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssr4Q62186 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssr4Q62186 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssr4Q62186 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssr4Q62186 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssr4Q62186 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssr4Q62186 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssr4Q62186 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssr4Q62186 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssr4Q62186 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssr4Q62186 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssr4Q62186 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssr4Q62186 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssr4Q62186 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ssr4Q62186 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssr4Q62186 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssr4Q62186 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssr4Q62186 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssr4Q62186 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssr4Q62186 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssr4Q62186 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssr4Q62186 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssr4Q62186 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssr4Q62186 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssr4Q62186 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssr4Q62186 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssr4Q62186 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssr4Q62186 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssr4Q62186 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssr4Q62186 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssr4Q62186 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssr4Q62186 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssr4Q62186 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms