Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sema4bQ62179 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema4bQ62179 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema4bQ62179 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sema4bQ62179 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema4bQ62179 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema4bQ62179 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema4bQ62179 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema4bQ62179 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema4bQ62179 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema4bQ62179 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema4bQ62179 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema4bQ62179 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema4bQ62179 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema4bQ62179 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema4bQ62179 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sema4bQ62179 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Sema4bQ62179 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema4bQ62179 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema4bQ62179 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema4bQ62179 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema4bQ62179 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema4bQ62179 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema4bQ62179 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema4bQ62179 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema4bQ62179 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema4bQ62179 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema4bQ62179 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema4bQ62179 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema4bQ62179 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema4bQ62179 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema4bQ62179 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema4bQ62179 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema4bQ62179 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema4bQ62179 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema4bQ62179 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema4bQ62179 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema4bQ62179 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema4bQ62179 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema4bQ62179 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema4bQ62179 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema4bQ62179 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sema4bQ62179 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sema4bQ62179 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema4bQ62179 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sema4bQ62179 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema4bQ62179 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema4bQ62179 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema4bQ62179 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sema4bQ62179 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema4bQ62179 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sema4bQ62179 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sema4bQ62179 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sema4bQ62179 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms