Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pik3c2aQ61194 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Pik3c2aQ61194 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pik3c2aQ61194 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Pik3c2aQ61194 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Pik3c2aQ61194 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pik3c2aQ61194 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pik3c2aQ61194 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pik3c2aQ61194 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pik3c2aQ61194 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pik3c2aQ61194 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pik3c2aQ61194 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Pik3c2aQ61194 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Pik3c2aQ61194 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Pik3c2aQ61194 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Pik3c2aQ61194 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Pik3c2aQ61194 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Pik3c2aQ61194 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Pik3c2aQ61194 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Pik3c2aQ61194 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pik3c2aQ61194 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Pik3c2aQ61194 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pik3c2aQ61194 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pik3c2aQ61194 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pik3c2aQ61194 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Pik3c2aQ61194 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Pik3c2aQ61194 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Pik3c2aQ61194 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Pik3c2aQ61194 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Pik3c2aQ61194 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pik3c2aQ61194 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Pik3c2aQ61194 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Pik3c2aQ61194 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pik3c2aQ61194 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Pik3c2aQ61194 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Pik3c2aQ61194 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Pik3c2aQ61194 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pik3c2aQ61194 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Pik3c2aQ61194 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Pik3c2aQ61194 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Pik3c2aQ61194 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Pik3c2aQ61194 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Pik3c2aQ61194 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pik3c2aQ61194 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pik3c2aQ61194 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pik3c2aQ61194 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pik3c2aQ61194 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pik3c2aQ61194 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Pik3c2aQ61194 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Pik3c2aQ61194 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pik3c2aQ61194 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pik3c2aQ61194 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pik3c2aQ61194 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Pik3c2aQ61194 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
Pik3c2aQ61194 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Pik3c2aQ61194 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Pik3c2aQ61194 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Pik3c2aQ61194 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Pik3c2aQ61194 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Pik3c2aQ61194 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Pik3c2aQ61194 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Pik3c2aQ61194 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Pik3c2aQ61194 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Pik3c2aQ61194 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Pik3c2aQ61194 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pik3c2aQ61194 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Pik3c2aQ61194 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pik3c2aQ61194 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Pik3c2aQ61194 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Pik3c2aQ61194 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Pik3c2aQ61194 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Pik3c2aQ61194 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pik3c2aQ61194 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Pik3c2aQ61194 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pik3c2aQ61194 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Pik3c2aQ61194 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pik3c2aQ61194 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Pik3c2aQ61194 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pik3c2aQ61194 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Pik3c2aQ61194 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pik3c2aQ61194 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pik3c2aQ61194 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pik3c2aQ61194 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pik3c2aQ61194 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pik3c2aQ61194 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Pik3c2aQ61194 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Pik3c2aQ61194 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Pik3c2aQ61194 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Pik3c2aQ61194 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Pik3c2aQ61194 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pik3c2aQ61194 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Pik3c2aQ61194 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pik3c2aQ61194 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pik3c2aQ61194 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pik3c2aQ61194 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pik3c2aQ61194 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Pik3c2aQ61194 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Pik3c2aQ61194 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pik3c2aQ61194 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pik3c2aQ61194 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms