Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Meis1Q60954 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Meis1Q60954 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Meis1Q60954 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Meis1Q60954 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Meis1Q60954 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Meis1Q60954 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Meis1Q60954 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Meis1Q60954 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Meis1Q60954 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Meis1Q60954 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Meis1Q60954 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Meis1Q60954 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Meis1Q60954 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Meis1Q60954 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Meis1Q60954 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Meis1Q60954 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Meis1Q60954 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Meis1Q60954 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Meis1Q60954 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Meis1Q60954 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Meis1Q60954 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Meis1Q60954 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Meis1Q60954 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Meis1Q60954 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Meis1Q60954 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Meis1Q60954 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Meis1Q60954 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Meis1Q60954 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Meis1Q60954 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Meis1Q60954 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Meis1Q60954 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Meis1Q60954 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Meis1Q60954 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Meis1Q60954 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Meis1Q60954 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Meis1Q60954 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Meis1Q60954 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Meis1Q60954 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Meis1Q60954 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Meis1Q60954 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Meis1Q60954 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Meis1Q60954 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Meis1Q60954 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Meis1Q60954 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Meis1Q60954 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Meis1Q60954 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Meis1Q60954 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Meis1Q60954 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Meis1Q60954 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Meis1Q60954 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Meis1Q60954 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Meis1Q60954 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Meis1Q60954 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Meis1Q60954 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Meis1Q60954 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Meis1Q60954 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Meis1Q60954 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Meis1Q60954 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Meis1Q60954 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Meis1Q60954 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Meis1Q60954 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Meis1Q60954 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Meis1Q60954 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Meis1Q60954 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Meis1Q60954 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Meis1Q60954 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Meis1Q60954 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Meis1Q60954 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Meis1Q60954 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Meis1Q60954 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Meis1Q60954 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Meis1Q60954 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Meis1Q60954 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Meis1Q60954 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Meis1Q60954 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Meis1Q60954 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Meis1Q60954 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Meis1Q60954 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Meis1Q60954 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Meis1Q60954 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Meis1Q60954 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Meis1Q60954 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Meis1Q60954 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Meis1Q60954 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Meis1Q60954 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Meis1Q60954 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Meis1Q60954 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Meis1Q60954 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Meis1Q60954 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Meis1Q60954 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Meis1Q60954 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Meis1Q60954 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Meis1Q60954 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Meis1Q60954 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Meis1Q60954 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Meis1Q60954 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Meis1Q60954 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Meis1Q60954 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Meis1Q60954 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms