Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cep250Q60952 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cep250Q60952 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cep250Q60952 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cep250Q60952 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cep250Q60952 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cep250Q60952 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cep250Q60952 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cep250Q60952 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cep250Q60952 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cep250Q60952 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cep250Q60952 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cep250Q60952 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cep250Q60952 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cep250Q60952 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cep250Q60952 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cep250Q60952 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cep250Q60952 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cep250Q60952 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cep250Q60952 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cep250Q60952 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cep250Q60952 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cep250Q60952 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cep250Q60952 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cep250Q60952 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cep250Q60952 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cep250Q60952 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cep250Q60952 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cep250Q60952 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cep250Q60952 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cep250Q60952 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cep250Q60952 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cep250Q60952 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cep250Q60952 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cep250Q60952 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cep250Q60952 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cep250Q60952 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cep250Q60952 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cep250Q60952 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cep250Q60952 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cep250Q60952 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cep250Q60952 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cep250Q60952 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cep250Q60952 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cep250Q60952 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cep250Q60952 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cep250Q60952 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cep250Q60952 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cep250Q60952 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cep250Q60952 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cep250Q60952 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Cep250Q60952 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cep250Q60952 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cep250Q60952 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cep250Q60952 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cep250Q60952 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cep250Q60952 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cep250Q60952 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cep250Q60952 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cep250Q60952 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep250Q60952 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep250Q60952 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep250Q60952 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep250Q60952 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep250Q60952 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cep250Q60952 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep250Q60952 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cep250Q60952 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cep250Q60952 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep250Q60952 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep250Q60952 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep250Q60952 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep250Q60952 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep250Q60952 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cep250Q60952 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep250Q60952 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep250Q60952 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Cep250Q60952 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cep250Q60952 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms