Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DbpQ60925 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DbpQ60925 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DbpQ60925 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DbpQ60925 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DbpQ60925 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DbpQ60925 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DbpQ60925 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DbpQ60925 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DbpQ60925 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DbpQ60925 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DbpQ60925 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DbpQ60925 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DbpQ60925 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DbpQ60925 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DbpQ60925 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DbpQ60925 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DbpQ60925 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DbpQ60925 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DbpQ60925 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DbpQ60925 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DbpQ60925 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DbpQ60925 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DbpQ60925 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DbpQ60925 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DbpQ60925 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DbpQ60925 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DbpQ60925 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
DbpQ60925 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DbpQ60925 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DbpQ60925 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DbpQ60925 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DbpQ60925 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DbpQ60925 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DbpQ60925 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DbpQ60925 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DbpQ60925 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DbpQ60925 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DbpQ60925 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DbpQ60925 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DbpQ60925 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DbpQ60925 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DbpQ60925 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DbpQ60925 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DbpQ60925 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DbpQ60925 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DbpQ60925 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DbpQ60925 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DbpQ60925 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DbpQ60925 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DbpQ60925 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DbpQ60925 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DbpQ60925 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DbpQ60925 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DbpQ60925 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DbpQ60925 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DbpQ60925 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DbpQ60925 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DbpQ60925 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DbpQ60925 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DbpQ60925 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms