Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkn2cQ60772 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkn2cQ60772 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkn2cQ60772 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkn2cQ60772 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkn2cQ60772 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkn2cQ60772 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkn2cQ60772 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkn2cQ60772 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkn2cQ60772 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkn2cQ60772 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkn2cQ60772 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkn2cQ60772 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkn2cQ60772 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkn2cQ60772 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkn2cQ60772 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkn2cQ60772 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkn2cQ60772 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdkn2cQ60772 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkn2cQ60772 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkn2cQ60772 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkn2cQ60772 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkn2cQ60772 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkn2cQ60772 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkn2cQ60772 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkn2cQ60772 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkn2cQ60772 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkn2cQ60772 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkn2cQ60772 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkn2cQ60772 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkn2cQ60772 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkn2cQ60772 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkn2cQ60772 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdkn2cQ60772 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdkn2cQ60772 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdkn2cQ60772 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdkn2cQ60772 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdkn2cQ60772 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms