Protein–RNA interactions for Protein: Q60754

Marco, Macrophage receptor MARCO, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MarcoQ60754 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MarcoQ60754 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MarcoQ60754 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MarcoQ60754 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MarcoQ60754 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MarcoQ60754 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MarcoQ60754 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MarcoQ60754 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MarcoQ60754 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MarcoQ60754 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MarcoQ60754 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MarcoQ60754 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MarcoQ60754 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MarcoQ60754 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MarcoQ60754 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MarcoQ60754 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MarcoQ60754 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MarcoQ60754 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MarcoQ60754 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MarcoQ60754 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MarcoQ60754 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MarcoQ60754 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MarcoQ60754 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MarcoQ60754 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MarcoQ60754 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MarcoQ60754 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MarcoQ60754 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MarcoQ60754 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MarcoQ60754 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MarcoQ60754 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MarcoQ60754 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MarcoQ60754 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MarcoQ60754 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MarcoQ60754 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MarcoQ60754 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MarcoQ60754 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MarcoQ60754 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MarcoQ60754 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MarcoQ60754 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MarcoQ60754 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MarcoQ60754 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MarcoQ60754 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MarcoQ60754 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MarcoQ60754 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MarcoQ60754 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MarcoQ60754 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MarcoQ60754 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MarcoQ60754 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MarcoQ60754 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MarcoQ60754 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MarcoQ60754 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MarcoQ60754 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MarcoQ60754 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MarcoQ60754 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MarcoQ60754 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MarcoQ60754 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MarcoQ60754 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MarcoQ60754 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MarcoQ60754 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MarcoQ60754 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MarcoQ60754 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MarcoQ60754 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MarcoQ60754 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MarcoQ60754 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MarcoQ60754 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MarcoQ60754 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MarcoQ60754 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MarcoQ60754 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MarcoQ60754 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MarcoQ60754 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MarcoQ60754 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MarcoQ60754 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MarcoQ60754 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MarcoQ60754 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MarcoQ60754 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MarcoQ60754 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MarcoQ60754 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MarcoQ60754 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MarcoQ60754 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms