Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Slc27a1Q60714 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc27a1Q60714 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc27a1Q60714 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Slc27a1Q60714 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc27a1Q60714 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Slc27a1Q60714 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc27a1Q60714 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slc27a1Q60714 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc27a1Q60714 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc27a1Q60714 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc27a1Q60714 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc27a1Q60714 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc27a1Q60714 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slc27a1Q60714 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slc27a1Q60714 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc27a1Q60714 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc27a1Q60714 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc27a1Q60714 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slc27a1Q60714 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc27a1Q60714 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc27a1Q60714 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Slc27a1Q60714 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Slc27a1Q60714 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Slc27a1Q60714 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slc27a1Q60714 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc27a1Q60714 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slc27a1Q60714 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc27a1Q60714 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc27a1Q60714 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc27a1Q60714 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc27a1Q60714 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc27a1Q60714 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc27a1Q60714 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc27a1Q60714 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc27a1Q60714 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc27a1Q60714 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc27a1Q60714 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc27a1Q60714 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc27a1Q60714 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc27a1Q60714 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc27a1Q60714 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc27a1Q60714 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc27a1Q60714 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc27a1Q60714 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc27a1Q60714 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc27a1Q60714 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc27a1Q60714 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc27a1Q60714 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc27a1Q60714 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc27a1Q60714 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc27a1Q60714 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc27a1Q60714 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc27a1Q60714 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc27a1Q60714 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc27a1Q60714 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc27a1Q60714 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc27a1Q60714 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc27a1Q60714 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc27a1Q60714 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc27a1Q60714 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms