Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HnrnpdQ60668 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HnrnpdQ60668 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HnrnpdQ60668 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HnrnpdQ60668 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HnrnpdQ60668 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HnrnpdQ60668 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HnrnpdQ60668 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HnrnpdQ60668 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HnrnpdQ60668 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HnrnpdQ60668 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HnrnpdQ60668 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HnrnpdQ60668 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HnrnpdQ60668 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HnrnpdQ60668 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HnrnpdQ60668 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HnrnpdQ60668 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HnrnpdQ60668 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HnrnpdQ60668 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HnrnpdQ60668 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HnrnpdQ60668 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HnrnpdQ60668 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HnrnpdQ60668 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HnrnpdQ60668 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HnrnpdQ60668 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HnrnpdQ60668 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HnrnpdQ60668 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HnrnpdQ60668 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HnrnpdQ60668 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HnrnpdQ60668 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HnrnpdQ60668 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HnrnpdQ60668 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HnrnpdQ60668 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HnrnpdQ60668 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HnrnpdQ60668 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HnrnpdQ60668 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HnrnpdQ60668 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HnrnpdQ60668 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HnrnpdQ60668 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HnrnpdQ60668 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HnrnpdQ60668 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HnrnpdQ60668 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HnrnpdQ60668 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HnrnpdQ60668 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HnrnpdQ60668 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HnrnpdQ60668 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HnrnpdQ60668 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HnrnpdQ60668 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HnrnpdQ60668 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HnrnpdQ60668 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HnrnpdQ60668 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HnrnpdQ60668 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms