Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Satb1Q60611 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Satb1Q60611 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Satb1Q60611 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Satb1Q60611 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Satb1Q60611 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Satb1Q60611 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Satb1Q60611 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Satb1Q60611 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Satb1Q60611 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Satb1Q60611 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Satb1Q60611 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Satb1Q60611 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Satb1Q60611 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Satb1Q60611 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Satb1Q60611 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Satb1Q60611 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Satb1Q60611 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Satb1Q60611 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Satb1Q60611 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Satb1Q60611 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Satb1Q60611 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Satb1Q60611 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Satb1Q60611 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Satb1Q60611 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Satb1Q60611 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Satb1Q60611 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Satb1Q60611 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Satb1Q60611 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Satb1Q60611 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Satb1Q60611 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Satb1Q60611 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Satb1Q60611 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Satb1Q60611 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Satb1Q60611 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Satb1Q60611 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Satb1Q60611 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Satb1Q60611 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Satb1Q60611 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Satb1Q60611 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Satb1Q60611 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Satb1Q60611 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Satb1Q60611 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Satb1Q60611 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Satb1Q60611 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Satb1Q60611 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Satb1Q60611 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Satb1Q60611 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Satb1Q60611 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Satb1Q60611 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Satb1Q60611 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Satb1Q60611 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Satb1Q60611 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Satb1Q60611 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Satb1Q60611 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Satb1Q60611 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Satb1Q60611 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Satb1Q60611 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Satb1Q60611 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Satb1Q60611 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Satb1Q60611 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Satb1Q60611 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Satb1Q60611 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Satb1Q60611 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Satb1Q60611 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Satb1Q60611 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Satb1Q60611 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Satb1Q60611 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Satb1Q60611 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Satb1Q60611 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Satb1Q60611 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms