Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4E2

Repin1, Replication initiator 1, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Repin1Q5U4E2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Repin1Q5U4E2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Repin1Q5U4E2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Repin1Q5U4E2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Repin1Q5U4E2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Repin1Q5U4E2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Repin1Q5U4E2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Repin1Q5U4E2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Repin1Q5U4E2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Repin1Q5U4E2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Repin1Q5U4E2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Repin1Q5U4E2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Repin1Q5U4E2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Repin1Q5U4E2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Repin1Q5U4E2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Repin1Q5U4E2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Repin1Q5U4E2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Repin1Q5U4E2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Repin1Q5U4E2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Repin1Q5U4E2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Repin1Q5U4E2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Repin1Q5U4E2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Repin1Q5U4E2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Repin1Q5U4E2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Repin1Q5U4E2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Repin1Q5U4E2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Repin1Q5U4E2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Repin1Q5U4E2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Repin1Q5U4E2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Repin1Q5U4E2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Repin1Q5U4E2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Repin1Q5U4E2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Repin1Q5U4E2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Repin1Q5U4E2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Repin1Q5U4E2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Repin1Q5U4E2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Repin1Q5U4E2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Repin1Q5U4E2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Repin1Q5U4E2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Repin1Q5U4E2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Repin1Q5U4E2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Repin1Q5U4E2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Repin1Q5U4E2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Repin1Q5U4E2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Repin1Q5U4E2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Repin1Q5U4E2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Repin1Q5U4E2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Repin1Q5U4E2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Repin1Q5U4E2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Repin1Q5U4E2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Repin1Q5U4E2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Repin1Q5U4E2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Repin1Q5U4E2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Repin1Q5U4E2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Repin1Q5U4E2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Repin1Q5U4E2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Repin1Q5U4E2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Repin1Q5U4E2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Repin1Q5U4E2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Repin1Q5U4E2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Repin1Q5U4E2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Repin1Q5U4E2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Repin1Q5U4E2 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Repin1Q5U4E2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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