Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rabl6Q5U3K5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rabl6Q5U3K5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rabl6Q5U3K5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rabl6Q5U3K5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabl6Q5U3K5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rabl6Q5U3K5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rabl6Q5U3K5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabl6Q5U3K5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabl6Q5U3K5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabl6Q5U3K5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabl6Q5U3K5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rabl6Q5U3K5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rabl6Q5U3K5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabl6Q5U3K5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabl6Q5U3K5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabl6Q5U3K5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabl6Q5U3K5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rabl6Q5U3K5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rabl6Q5U3K5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rabl6Q5U3K5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rabl6Q5U3K5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rabl6Q5U3K5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rabl6Q5U3K5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rabl6Q5U3K5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rabl6Q5U3K5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rabl6Q5U3K5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rabl6Q5U3K5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rabl6Q5U3K5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabl6Q5U3K5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rabl6Q5U3K5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms