Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med13Q5SWW4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med13Q5SWW4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med13Q5SWW4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med13Q5SWW4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med13Q5SWW4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med13Q5SWW4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med13Q5SWW4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med13Q5SWW4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med13Q5SWW4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med13Q5SWW4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med13Q5SWW4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med13Q5SWW4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med13Q5SWW4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med13Q5SWW4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Med13Q5SWW4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Med13Q5SWW4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med13Q5SWW4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med13Q5SWW4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Med13Q5SWW4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Med13Q5SWW4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med13Q5SWW4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms