Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r196Q5SVD5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r196Q5SVD5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r196Q5SVD5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r196Q5SVD5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r196Q5SVD5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r196Q5SVD5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r196Q5SVD5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r196Q5SVD5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r196Q5SVD5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r196Q5SVD5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r196Q5SVD5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r196Q5SVD5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r196Q5SVD5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r196Q5SVD5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r196Q5SVD5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r196Q5SVD5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r196Q5SVD5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r196Q5SVD5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r196Q5SVD5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r196Q5SVD5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms