Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Utp18Q5SSI6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Utp18Q5SSI6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Utp18Q5SSI6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Utp18Q5SSI6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Utp18Q5SSI6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Utp18Q5SSI6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Utp18Q5SSI6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Utp18Q5SSI6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Utp18Q5SSI6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Utp18Q5SSI6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Utp18Q5SSI6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Utp18Q5SSI6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27,7■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27,7■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Utp18Q5SSI6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Utp18Q5SSI6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,02
Utp18Q5SSI6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Utp18Q5SSI6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Utp18Q5SSI6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Utp18Q5SSI6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Utp18Q5SSI6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Utp18Q5SSI6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Utp18Q5SSI6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Utp18Q5SSI6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Utp18Q5SSI6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Utp18Q5SSI6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Utp18Q5SSI6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Utp18Q5SSI6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Utp18Q5SSI6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Utp18Q5SSI6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Utp18Q5SSI6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Utp18Q5SSI6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27,65■■■□□ 2,02
Utp18Q5SSI6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Utp18Q5SSI6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Utp18Q5SSI6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Utp18Q5SSI6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Utp18Q5SSI6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Utp18Q5SSI6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Utp18Q5SSI6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Utp18Q5SSI6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Utp18Q5SSI6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Utp18Q5SSI6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Utp18Q5SSI6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Utp18Q5SSI6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Utp18Q5SSI6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Utp18Q5SSI6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Utp18Q5SSI6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Utp18Q5SSI6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Utp18Q5SSI6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2
Utp18Q5SSI6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Utp18Q5SSI6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Utp18Q5SSI6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Utp18Q5SSI6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Utp18Q5SSI6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Utp18Q5SSI6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Utp18Q5SSI6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Utp18Q5SSI6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27,55■■■□□ 2
Utp18Q5SSI6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,54■■■□□ 2
Utp18Q5SSI6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Utp18Q5SSI6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Utp18Q5SSI6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Utp18Q5SSI6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Utp18Q5SSI6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms