Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQX6

Cyfip2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip2Q5SQX6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyfip2Q5SQX6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyfip2Q5SQX6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyfip2Q5SQX6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyfip2Q5SQX6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyfip2Q5SQX6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyfip2Q5SQX6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyfip2Q5SQX6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyfip2Q5SQX6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyfip2Q5SQX6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyfip2Q5SQX6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyfip2Q5SQX6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyfip2Q5SQX6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyfip2Q5SQX6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyfip2Q5SQX6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyfip2Q5SQX6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyfip2Q5SQX6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyfip2Q5SQX6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyfip2Q5SQX6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyfip2Q5SQX6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyfip2Q5SQX6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyfip2Q5SQX6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyfip2Q5SQX6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyfip2Q5SQX6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyfip2Q5SQX6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyfip2Q5SQX6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyfip2Q5SQX6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyfip2Q5SQX6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyfip2Q5SQX6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cyfip2Q5SQX6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cyfip2Q5SQX6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyfip2Q5SQX6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cyfip2Q5SQX6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyfip2Q5SQX6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyfip2Q5SQX6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cyfip2Q5SQX6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyfip2Q5SQX6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cyfip2Q5SQX6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyfip2Q5SQX6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyfip2Q5SQX6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyfip2Q5SQX6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyfip2Q5SQX6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyfip2Q5SQX6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cyfip2Q5SQX6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cyfip2Q5SQX6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cyfip2Q5SQX6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyfip2Q5SQX6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyfip2Q5SQX6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cyfip2Q5SQX6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cyfip2Q5SQX6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cyfip2Q5SQX6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cyfip2Q5SQX6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyfip2Q5SQX6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms