Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ecm2Q5FW85 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ecm2Q5FW85 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ecm2Q5FW85 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ecm2Q5FW85 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ecm2Q5FW85 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ecm2Q5FW85 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ecm2Q5FW85 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ecm2Q5FW85 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ecm2Q5FW85 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ecm2Q5FW85 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ecm2Q5FW85 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ecm2Q5FW85 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ecm2Q5FW85 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Ecm2Q5FW85 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ecm2Q5FW85 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ecm2Q5FW85 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Ecm2Q5FW85 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ecm2Q5FW85 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ecm2Q5FW85 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ecm2Q5FW85 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ecm2Q5FW85 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Ecm2Q5FW85 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ecm2Q5FW85 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ecm2Q5FW85 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ecm2Q5FW85 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ecm2Q5FW85 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Ecm2Q5FW85 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ecm2Q5FW85 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ecm2Q5FW85 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ecm2Q5FW85 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ecm2Q5FW85 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ecm2Q5FW85 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ecm2Q5FW85 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ecm2Q5FW85 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ecm2Q5FW85 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Ecm2Q5FW85 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ecm2Q5FW85 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ecm2Q5FW85 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ecm2Q5FW85 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ecm2Q5FW85 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ecm2Q5FW85 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ecm2Q5FW85 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Ecm2Q5FW85 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ecm2Q5FW85 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ecm2Q5FW85 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ecm2Q5FW85 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ecm2Q5FW85 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ecm2Q5FW85 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ecm2Q5FW85 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ecm2Q5FW85 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ecm2Q5FW85 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ecm2Q5FW85 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ecm2Q5FW85 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ecm2Q5FW85 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ecm2Q5FW85 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ecm2Q5FW85 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ecm2Q5FW85 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ecm2Q5FW85 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ecm2Q5FW85 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ecm2Q5FW85 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ecm2Q5FW85 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ecm2Q5FW85 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ecm2Q5FW85 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ecm2Q5FW85 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ecm2Q5FW85 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ecm2Q5FW85 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ecm2Q5FW85 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ecm2Q5FW85 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ecm2Q5FW85 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ecm2Q5FW85 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ecm2Q5FW85 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ecm2Q5FW85 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ecm2Q5FW85 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ecm2Q5FW85 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ecm2Q5FW85 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ecm2Q5FW85 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ecm2Q5FW85 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Ecm2Q5FW85 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ecm2Q5FW85 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Ecm2Q5FW85 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ecm2Q5FW85 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ecm2Q5FW85 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ecm2Q5FW85 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ecm2Q5FW85 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ecm2Q5FW85 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ecm2Q5FW85 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ecm2Q5FW85 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Ecm2Q5FW85 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Ecm2Q5FW85 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ecm2Q5FW85 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ecm2Q5FW85 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Ecm2Q5FW85 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ecm2Q5FW85 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ecm2Q5FW85 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Ecm2Q5FW85 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ecm2Q5FW85 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ecm2Q5FW85 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ecm2Q5FW85 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Ecm2Q5FW85 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms