Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZRW6

Clul1, Clusterin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clul1Q3ZRW6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Clul1Q3ZRW6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Clul1Q3ZRW6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clul1Q3ZRW6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clul1Q3ZRW6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clul1Q3ZRW6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Clul1Q3ZRW6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clul1Q3ZRW6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clul1Q3ZRW6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clul1Q3ZRW6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Clul1Q3ZRW6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clul1Q3ZRW6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clul1Q3ZRW6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clul1Q3ZRW6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clul1Q3ZRW6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clul1Q3ZRW6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clul1Q3ZRW6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Clul1Q3ZRW6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clul1Q3ZRW6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clul1Q3ZRW6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Clul1Q3ZRW6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clul1Q3ZRW6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Clul1Q3ZRW6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clul1Q3ZRW6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Clul1Q3ZRW6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clul1Q3ZRW6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Clul1Q3ZRW6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Clul1Q3ZRW6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clul1Q3ZRW6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Clul1Q3ZRW6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Clul1Q3ZRW6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Clul1Q3ZRW6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Clul1Q3ZRW6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Clul1Q3ZRW6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Clul1Q3ZRW6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Clul1Q3ZRW6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clul1Q3ZRW6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Clul1Q3ZRW6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clul1Q3ZRW6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clul1Q3ZRW6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clul1Q3ZRW6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clul1Q3ZRW6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clul1Q3ZRW6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Clul1Q3ZRW6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clul1Q3ZRW6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clul1Q3ZRW6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Clul1Q3ZRW6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clul1Q3ZRW6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Clul1Q3ZRW6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clul1Q3ZRW6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clul1Q3ZRW6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clul1Q3ZRW6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clul1Q3ZRW6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clul1Q3ZRW6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clul1Q3ZRW6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clul1Q3ZRW6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clul1Q3ZRW6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clul1Q3ZRW6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clul1Q3ZRW6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clul1Q3ZRW6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Clul1Q3ZRW6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms