Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim26Q3V460 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim26Q3V460 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smim26Q3V460 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smim26Q3V460 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms