Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
4933416C03RikQ3V063 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
4933416C03RikQ3V063 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
4933416C03RikQ3V063 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
4933416C03RikQ3V063 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
4933416C03RikQ3V063 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
4933416C03RikQ3V063 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
4933416C03RikQ3V063 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
4933416C03RikQ3V063 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
4933416C03RikQ3V063 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
4933416C03RikQ3V063 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
4933416C03RikQ3V063 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
4933416C03RikQ3V063 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
4933416C03RikQ3V063 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
4933416C03RikQ3V063 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
4933416C03RikQ3V063 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
4933416C03RikQ3V063 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
4933416C03RikQ3V063 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
4933416C03RikQ3V063 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
4933416C03RikQ3V063 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
4933416C03RikQ3V063 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
4933416C03RikQ3V063 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
4933416C03RikQ3V063 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
4933416C03RikQ3V063 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
4933416C03RikQ3V063 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
4933416C03RikQ3V063 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
4933416C03RikQ3V063 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
4933416C03RikQ3V063 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
4933416C03RikQ3V063 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
4933416C03RikQ3V063 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
4933416C03RikQ3V063 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
4933416C03RikQ3V063 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
4933416C03RikQ3V063 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4933416C03RikQ3V063 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
4933416C03RikQ3V063 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
4933416C03RikQ3V063 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
4933416C03RikQ3V063 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
4933416C03RikQ3V063 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
4933416C03RikQ3V063 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms