Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc27Q3V036 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc27Q3V036 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc27Q3V036 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc27Q3V036 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc27Q3V036 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc27Q3V036 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc27Q3V036 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc27Q3V036 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc27Q3V036 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc27Q3V036 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc27Q3V036 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc27Q3V036 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc27Q3V036 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc27Q3V036 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc27Q3V036 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ccdc27Q3V036 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc27Q3V036 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc27Q3V036 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc27Q3V036 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc27Q3V036 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc27Q3V036 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc27Q3V036 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc27Q3V036 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc27Q3V036 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc27Q3V036 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc27Q3V036 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc27Q3V036 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc27Q3V036 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc27Q3V036 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc27Q3V036 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc27Q3V036 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc27Q3V036 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc27Q3V036 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc27Q3V036 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc27Q3V036 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc27Q3V036 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc27Q3V036 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc27Q3V036 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc27Q3V036 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc27Q3V036 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc27Q3V036 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc27Q3V036 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc27Q3V036 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc27Q3V036 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc27Q3V036 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc27Q3V036 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc27Q3V036 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc27Q3V036 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc27Q3V036 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc27Q3V036 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc27Q3V036 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc27Q3V036 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc27Q3V036 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc27Q3V036 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc27Q3V036 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ccdc27Q3V036 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc27Q3V036 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc27Q3V036 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc27Q3V036 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc27Q3V036 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc27Q3V036 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc27Q3V036 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc27Q3V036 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc27Q3V036 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc27Q3V036 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc27Q3V036 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc27Q3V036 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc27Q3V036 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc27Q3V036 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc27Q3V036 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc27Q3V036 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms