Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX66

7420426K07Rik, RIKEN cDNA 7420426K07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7420426K07RikQ3UX66 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
7420426K07RikQ3UX66 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
7420426K07RikQ3UX66 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
7420426K07RikQ3UX66 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
7420426K07RikQ3UX66 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
7420426K07RikQ3UX66 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
7420426K07RikQ3UX66 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
7420426K07RikQ3UX66 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
7420426K07RikQ3UX66 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
7420426K07RikQ3UX66 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
7420426K07RikQ3UX66 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
7420426K07RikQ3UX66 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
7420426K07RikQ3UX66 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
7420426K07RikQ3UX66 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
7420426K07RikQ3UX66 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
7420426K07RikQ3UX66 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms