Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clca4bQ3UW98 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clca4bQ3UW98 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Clca4bQ3UW98 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca4bQ3UW98 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca4bQ3UW98 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clca4bQ3UW98 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca4bQ3UW98 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca4bQ3UW98 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clca4bQ3UW98 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca4bQ3UW98 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clca4bQ3UW98 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clca4bQ3UW98 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clca4bQ3UW98 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clca4bQ3UW98 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clca4bQ3UW98 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clca4bQ3UW98 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clca4bQ3UW98 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clca4bQ3UW98 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clca4bQ3UW98 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Clca4bQ3UW98 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clca4bQ3UW98 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca4bQ3UW98 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca4bQ3UW98 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca4bQ3UW98 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca4bQ3UW98 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca4bQ3UW98 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca4bQ3UW98 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca4bQ3UW98 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms