Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUF8

Ankrd34b, Ankyrin repeat domain-containing protein 34B, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34bQ3UUF8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ankrd34bQ3UUF8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ankrd34bQ3UUF8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ankrd34bQ3UUF8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd34bQ3UUF8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd34bQ3UUF8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ankrd34bQ3UUF8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ankrd34bQ3UUF8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd34bQ3UUF8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd34bQ3UUF8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd34bQ3UUF8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd34bQ3UUF8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd34bQ3UUF8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd34bQ3UUF8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd34bQ3UUF8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd34bQ3UUF8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd34bQ3UUF8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ankrd34bQ3UUF8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd34bQ3UUF8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd34bQ3UUF8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd34bQ3UUF8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd34bQ3UUF8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd34bQ3UUF8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd34bQ3UUF8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd34bQ3UUF8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd34bQ3UUF8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd34bQ3UUF8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd34bQ3UUF8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd34bQ3UUF8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd34bQ3UUF8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd34bQ3UUF8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd34bQ3UUF8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd34bQ3UUF8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ankrd34bQ3UUF8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ankrd34bQ3UUF8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd34bQ3UUF8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd34bQ3UUF8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd34bQ3UUF8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd34bQ3UUF8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd34bQ3UUF8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd34bQ3UUF8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd34bQ3UUF8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ankrd34bQ3UUF8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd34bQ3UUF8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd34bQ3UUF8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd34bQ3UUF8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd34bQ3UUF8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd34bQ3UUF8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd34bQ3UUF8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd34bQ3UUF8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd34bQ3UUF8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ankrd34bQ3UUF8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms