Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Smim15Q3UTD9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim15Q3UTD9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smim15Q3UTD9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim15Q3UTD9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim15Q3UTD9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms