Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP23

Tmem26, Transmembrane protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem26Q3UP23 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem26Q3UP23 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem26Q3UP23 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem26Q3UP23 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem26Q3UP23 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem26Q3UP23 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem26Q3UP23 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem26Q3UP23 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem26Q3UP23 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem26Q3UP23 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem26Q3UP23 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem26Q3UP23 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem26Q3UP23 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem26Q3UP23 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem26Q3UP23 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem26Q3UP23 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem26Q3UP23 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem26Q3UP23 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem26Q3UP23 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem26Q3UP23 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem26Q3UP23 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem26Q3UP23 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem26Q3UP23 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem26Q3UP23 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem26Q3UP23 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem26Q3UP23 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem26Q3UP23 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem26Q3UP23 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem26Q3UP23 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem26Q3UP23 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem26Q3UP23 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem26Q3UP23 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem26Q3UP23 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem26Q3UP23 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem26Q3UP23 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem26Q3UP23 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem26Q3UP23 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem26Q3UP23 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem26Q3UP23 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem26Q3UP23 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem26Q3UP23 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem26Q3UP23 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem26Q3UP23 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem26Q3UP23 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem26Q3UP23 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem26Q3UP23 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem26Q3UP23 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem26Q3UP23 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem26Q3UP23 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem26Q3UP23 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem26Q3UP23 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem26Q3UP23 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmem26Q3UP23 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem26Q3UP23 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem26Q3UP23 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem26Q3UP23 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem26Q3UP23 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms