Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd27Q3UMR0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd27Q3UMR0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd27Q3UMR0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd27Q3UMR0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms