Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrch2Q3UMG5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrch2Q3UMG5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrch2Q3UMG5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrch2Q3UMG5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrch2Q3UMG5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrch2Q3UMG5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrch2Q3UMG5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrch2Q3UMG5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrch2Q3UMG5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrch2Q3UMG5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrch2Q3UMG5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrch2Q3UMG5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrch2Q3UMG5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrch2Q3UMG5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrch2Q3UMG5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrch2Q3UMG5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrch2Q3UMG5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrch2Q3UMG5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrch2Q3UMG5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lrch2Q3UMG5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrch2Q3UMG5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrch2Q3UMG5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Lrch2Q3UMG5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lrch2Q3UMG5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrch2Q3UMG5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrch2Q3UMG5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrch2Q3UMG5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrch2Q3UMG5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrch2Q3UMG5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrch2Q3UMG5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrch2Q3UMG5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrch2Q3UMG5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrch2Q3UMG5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lrch2Q3UMG5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrch2Q3UMG5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrch2Q3UMG5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrch2Q3UMG5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrch2Q3UMG5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrch2Q3UMG5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrch2Q3UMG5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrch2Q3UMG5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrch2Q3UMG5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrch2Q3UMG5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrch2Q3UMG5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrch2Q3UMG5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrch2Q3UMG5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrch2Q3UMG5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrch2Q3UMG5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrch2Q3UMG5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lrch2Q3UMG5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lrch2Q3UMG5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrch2Q3UMG5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrch2Q3UMG5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrch2Q3UMG5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lrch2Q3UMG5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrch2Q3UMG5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrch2Q3UMG5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrch2Q3UMG5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrch2Q3UMG5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrch2Q3UMG5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrch2Q3UMG5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrch2Q3UMG5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrch2Q3UMG5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrch2Q3UMG5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrch2Q3UMG5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrch2Q3UMG5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrch2Q3UMG5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrch2Q3UMG5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrch2Q3UMG5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrch2Q3UMG5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrch2Q3UMG5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrch2Q3UMG5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrch2Q3UMG5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrch2Q3UMG5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrch2Q3UMG5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrch2Q3UMG5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrch2Q3UMG5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265.1 ms