Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cog7Q3UM29 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cog7Q3UM29 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cog7Q3UM29 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cog7Q3UM29 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cog7Q3UM29 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cog7Q3UM29 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cog7Q3UM29 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cog7Q3UM29 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cog7Q3UM29 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cog7Q3UM29 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cog7Q3UM29 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cog7Q3UM29 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog7Q3UM29 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog7Q3UM29 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cog7Q3UM29 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cog7Q3UM29 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cog7Q3UM29 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cog7Q3UM29 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cog7Q3UM29 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cog7Q3UM29 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cog7Q3UM29 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog7Q3UM29 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog7Q3UM29 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog7Q3UM29 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog7Q3UM29 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cog7Q3UM29 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cog7Q3UM29 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cog7Q3UM29 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cog7Q3UM29 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cog7Q3UM29 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cog7Q3UM29 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cog7Q3UM29 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cog7Q3UM29 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cog7Q3UM29 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cog7Q3UM29 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cog7Q3UM29 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cog7Q3UM29 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cog7Q3UM29 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cog7Q3UM29 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cog7Q3UM29 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cog7Q3UM29 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cog7Q3UM29 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cog7Q3UM29 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cog7Q3UM29 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cog7Q3UM29 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cog7Q3UM29 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cog7Q3UM29 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cog7Q3UM29 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cog7Q3UM29 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cog7Q3UM29 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cog7Q3UM29 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cog7Q3UM29 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cog7Q3UM29 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cog7Q3UM29 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cog7Q3UM29 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cog7Q3UM29 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cog7Q3UM29 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cog7Q3UM29 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cog7Q3UM29 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cog7Q3UM29 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cog7Q3UM29 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cog7Q3UM29 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cog7Q3UM29 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cog7Q3UM29 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cog7Q3UM29 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cog7Q3UM29 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cog7Q3UM29 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cog7Q3UM29 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cog7Q3UM29 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cog7Q3UM29 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms