Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf5Q3UK78 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf5Q3UK78 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf5Q3UK78 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcgf5Q3UK78 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcgf5Q3UK78 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcgf5Q3UK78 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcgf5Q3UK78 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf5Q3UK78 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf5Q3UK78 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcgf5Q3UK78 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf5Q3UK78 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf5Q3UK78 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcgf5Q3UK78 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcgf5Q3UK78 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcgf5Q3UK78 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcgf5Q3UK78 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcgf5Q3UK78 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcgf5Q3UK78 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcgf5Q3UK78 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf5Q3UK78 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcgf5Q3UK78 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcgf5Q3UK78 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcgf5Q3UK78 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcgf5Q3UK78 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcgf5Q3UK78 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcgf5Q3UK78 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcgf5Q3UK78 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcgf5Q3UK78 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcgf5Q3UK78 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms