Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sf3b2Q3UJB0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Sf3b2Q3UJB0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sf3b2Q3UJB0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Sf3b2Q3UJB0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sf3b2Q3UJB0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Sf3b2Q3UJB0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sf3b2Q3UJB0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Sf3b2Q3UJB0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Sf3b2Q3UJB0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sf3b2Q3UJB0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sf3b2Q3UJB0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Sf3b2Q3UJB0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sf3b2Q3UJB0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sf3b2Q3UJB0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Sf3b2Q3UJB0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Sf3b2Q3UJB0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Sf3b2Q3UJB0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Sf3b2Q3UJB0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Sf3b2Q3UJB0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Sf3b2Q3UJB0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Sf3b2Q3UJB0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Sf3b2Q3UJB0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sf3b2Q3UJB0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Sf3b2Q3UJB0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Sf3b2Q3UJB0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Sf3b2Q3UJB0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Sf3b2Q3UJB0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Sf3b2Q3UJB0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Sf3b2Q3UJB0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Sf3b2Q3UJB0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Sf3b2Q3UJB0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Sf3b2Q3UJB0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Sf3b2Q3UJB0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Sf3b2Q3UJB0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Sf3b2Q3UJB0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Sf3b2Q3UJB0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Sf3b2Q3UJB0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Sf3b2Q3UJB0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Sf3b2Q3UJB0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Sf3b2Q3UJB0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Sf3b2Q3UJB0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Sf3b2Q3UJB0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Sf3b2Q3UJB0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Sf3b2Q3UJB0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Sf3b2Q3UJB0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Sf3b2Q3UJB0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Sf3b2Q3UJB0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Sf3b2Q3UJB0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sf3b2Q3UJB0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sf3b2Q3UJB0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sf3b2Q3UJB0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sf3b2Q3UJB0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Sf3b2Q3UJB0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Sf3b2Q3UJB0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Sf3b2Q3UJB0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Sf3b2Q3UJB0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Sf3b2Q3UJB0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Sf3b2Q3UJB0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Sf3b2Q3UJB0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Sf3b2Q3UJB0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Sf3b2Q3UJB0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Sf3b2Q3UJB0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Sf3b2Q3UJB0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Sf3b2Q3UJB0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Sf3b2Q3UJB0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Sf3b2Q3UJB0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Sf3b2Q3UJB0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Sf3b2Q3UJB0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Sf3b2Q3UJB0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Sf3b2Q3UJB0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Sf3b2Q3UJB0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Sf3b2Q3UJB0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Sf3b2Q3UJB0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Sf3b2Q3UJB0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sf3b2Q3UJB0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sf3b2Q3UJB0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sf3b2Q3UJB0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sf3b2Q3UJB0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sf3b2Q3UJB0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sf3b2Q3UJB0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sf3b2Q3UJB0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Sf3b2Q3UJB0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Sf3b2Q3UJB0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Sf3b2Q3UJB0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sf3b2Q3UJB0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sf3b2Q3UJB0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Sf3b2Q3UJB0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sf3b2Q3UJB0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms