Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dtx3lQ3UIR3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dtx3lQ3UIR3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dtx3lQ3UIR3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dtx3lQ3UIR3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dtx3lQ3UIR3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dtx3lQ3UIR3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dtx3lQ3UIR3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dtx3lQ3UIR3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dtx3lQ3UIR3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dtx3lQ3UIR3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dtx3lQ3UIR3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dtx3lQ3UIR3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dtx3lQ3UIR3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Dtx3lQ3UIR3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dtx3lQ3UIR3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dtx3lQ3UIR3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dtx3lQ3UIR3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dtx3lQ3UIR3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dtx3lQ3UIR3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dtx3lQ3UIR3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dtx3lQ3UIR3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dtx3lQ3UIR3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dtx3lQ3UIR3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dtx3lQ3UIR3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dtx3lQ3UIR3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dtx3lQ3UIR3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dtx3lQ3UIR3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dtx3lQ3UIR3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dtx3lQ3UIR3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dtx3lQ3UIR3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dtx3lQ3UIR3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dtx3lQ3UIR3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dtx3lQ3UIR3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dtx3lQ3UIR3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dtx3lQ3UIR3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dtx3lQ3UIR3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dtx3lQ3UIR3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dtx3lQ3UIR3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dtx3lQ3UIR3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dtx3lQ3UIR3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dtx3lQ3UIR3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dtx3lQ3UIR3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dtx3lQ3UIR3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dtx3lQ3UIR3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dtx3lQ3UIR3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dtx3lQ3UIR3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Dtx3lQ3UIR3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dtx3lQ3UIR3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dtx3lQ3UIR3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dtx3lQ3UIR3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dtx3lQ3UIR3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dtx3lQ3UIR3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dtx3lQ3UIR3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dtx3lQ3UIR3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dtx3lQ3UIR3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dtx3lQ3UIR3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dtx3lQ3UIR3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dtx3lQ3UIR3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dtx3lQ3UIR3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dtx3lQ3UIR3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dtx3lQ3UIR3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dtx3lQ3UIR3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dtx3lQ3UIR3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Dtx3lQ3UIR3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Dtx3lQ3UIR3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dtx3lQ3UIR3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dtx3lQ3UIR3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dtx3lQ3UIR3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dtx3lQ3UIR3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dtx3lQ3UIR3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dtx3lQ3UIR3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dtx3lQ3UIR3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dtx3lQ3UIR3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dtx3lQ3UIR3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dtx3lQ3UIR3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dtx3lQ3UIR3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dtx3lQ3UIR3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dtx3lQ3UIR3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dtx3lQ3UIR3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Dtx3lQ3UIR3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dtx3lQ3UIR3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dtx3lQ3UIR3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Dtx3lQ3UIR3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Dtx3lQ3UIR3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dtx3lQ3UIR3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dtx3lQ3UIR3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dtx3lQ3UIR3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dtx3lQ3UIR3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dtx3lQ3UIR3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dtx3lQ3UIR3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dtx3lQ3UIR3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dtx3lQ3UIR3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dtx3lQ3UIR3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dtx3lQ3UIR3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms