Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGC7

Eif3j1, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3j1Q3UGC7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Eif3j1Q3UGC7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Eif3j1Q3UGC7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Eif3j1Q3UGC7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Eif3j1Q3UGC7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Eif3j1Q3UGC7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Eif3j1Q3UGC7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Eif3j1Q3UGC7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Eif3j1Q3UGC7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Eif3j1Q3UGC7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Eif3j1Q3UGC7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Eif3j1Q3UGC7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Eif3j1Q3UGC7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Eif3j1Q3UGC7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Eif3j1Q3UGC7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Eif3j1Q3UGC7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Eif3j1Q3UGC7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Eif3j1Q3UGC7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Eif3j1Q3UGC7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Eif3j1Q3UGC7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Eif3j1Q3UGC7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Eif3j1Q3UGC7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Eif3j1Q3UGC7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Eif3j1Q3UGC7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Eif3j1Q3UGC7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Eif3j1Q3UGC7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Eif3j1Q3UGC7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Eif3j1Q3UGC7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Eif3j1Q3UGC7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Eif3j1Q3UGC7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Eif3j1Q3UGC7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Eif3j1Q3UGC7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Eif3j1Q3UGC7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Eif3j1Q3UGC7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Eif3j1Q3UGC7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Eif3j1Q3UGC7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Eif3j1Q3UGC7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Eif3j1Q3UGC7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Eif3j1Q3UGC7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Eif3j1Q3UGC7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Eif3j1Q3UGC7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Eif3j1Q3UGC7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Eif3j1Q3UGC7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Eif3j1Q3UGC7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Eif3j1Q3UGC7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Eif3j1Q3UGC7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Eif3j1Q3UGC7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Eif3j1Q3UGC7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Eif3j1Q3UGC7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Eif3j1Q3UGC7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Eif3j1Q3UGC7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Eif3j1Q3UGC7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Eif3j1Q3UGC7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Eif3j1Q3UGC7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Eif3j1Q3UGC7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Eif3j1Q3UGC7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Eif3j1Q3UGC7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Eif3j1Q3UGC7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Eif3j1Q3UGC7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Eif3j1Q3UGC7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Eif3j1Q3UGC7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Eif3j1Q3UGC7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Eif3j1Q3UGC7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Eif3j1Q3UGC7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Eif3j1Q3UGC7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Eif3j1Q3UGC7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Eif3j1Q3UGC7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Eif3j1Q3UGC7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Eif3j1Q3UGC7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Eif3j1Q3UGC7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Eif3j1Q3UGC7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Eif3j1Q3UGC7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Eif3j1Q3UGC7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Eif3j1Q3UGC7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Eif3j1Q3UGC7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Eif3j1Q3UGC7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Eif3j1Q3UGC7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Eif3j1Q3UGC7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Eif3j1Q3UGC7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Eif3j1Q3UGC7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Eif3j1Q3UGC7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Eif3j1Q3UGC7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Eif3j1Q3UGC7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Eif3j1Q3UGC7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Eif3j1Q3UGC7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Eif3j1Q3UGC7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Eif3j1Q3UGC7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Eif3j1Q3UGC7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Eif3j1Q3UGC7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Eif3j1Q3UGC7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Eif3j1Q3UGC7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Eif3j1Q3UGC7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Eif3j1Q3UGC7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Eif3j1Q3UGC7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Eif3j1Q3UGC7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Eif3j1Q3UGC7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Eif3j1Q3UGC7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Eif3j1Q3UGC7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Eif3j1Q3UGC7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Eif3j1Q3UGC7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms