Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Yipf3Q3UDR8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Yipf3Q3UDR8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Yipf3Q3UDR8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Yipf3Q3UDR8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Yipf3Q3UDR8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms