Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hbq1bQ3U0A6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hbq1bQ3U0A6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hbq1bQ3U0A6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hbq1bQ3U0A6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hbq1bQ3U0A6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hbq1bQ3U0A6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hbq1bQ3U0A6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hbq1bQ3U0A6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hbq1bQ3U0A6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hbq1bQ3U0A6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hbq1bQ3U0A6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hbq1bQ3U0A6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hbq1bQ3U0A6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hbq1bQ3U0A6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hbq1bQ3U0A6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hbq1bQ3U0A6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hbq1bQ3U0A6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hbq1bQ3U0A6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hbq1bQ3U0A6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hbq1bQ3U0A6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hbq1bQ3U0A6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hbq1bQ3U0A6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hbq1bQ3U0A6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hbq1bQ3U0A6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hbq1bQ3U0A6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hbq1bQ3U0A6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hbq1bQ3U0A6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hbq1bQ3U0A6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hbq1bQ3U0A6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hbq1bQ3U0A6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hbq1bQ3U0A6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hbq1bQ3U0A6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hbq1bQ3U0A6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hbq1bQ3U0A6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hbq1bQ3U0A6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hbq1bQ3U0A6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hbq1bQ3U0A6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hbq1bQ3U0A6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hbq1bQ3U0A6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hbq1bQ3U0A6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hbq1bQ3U0A6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hbq1bQ3U0A6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hbq1bQ3U0A6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hbq1bQ3U0A6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hbq1bQ3U0A6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hbq1bQ3U0A6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hbq1bQ3U0A6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hbq1bQ3U0A6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hbq1bQ3U0A6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hbq1bQ3U0A6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hbq1bQ3U0A6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hbq1bQ3U0A6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hbq1bQ3U0A6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hbq1bQ3U0A6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hbq1bQ3U0A6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hbq1bQ3U0A6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hbq1bQ3U0A6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hbq1bQ3U0A6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hbq1bQ3U0A6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms