Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp13a5Q3TYU2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp13a5Q3TYU2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp13a5Q3TYU2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a5Q3TYU2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a5Q3TYU2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a5Q3TYU2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a5Q3TYU2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp13a5Q3TYU2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a5Q3TYU2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp13a5Q3TYU2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp13a5Q3TYU2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp13a5Q3TYU2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a5Q3TYU2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a5Q3TYU2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp13a5Q3TYU2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp13a5Q3TYU2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a5Q3TYU2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a5Q3TYU2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a5Q3TYU2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp13a5Q3TYU2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp13a5Q3TYU2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp13a5Q3TYU2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms