Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3TTJ4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3TTJ4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3TTJ4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q3TTJ4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3TTJ4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3TTJ4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3TTJ4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3TTJ4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3TTJ4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3TTJ4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q3TTJ4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3TTJ4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3TTJ4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3TTJ4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q3TTJ4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3TTJ4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3TTJ4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3TTJ4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q3TTJ4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3TTJ4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q3TTJ4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3TTJ4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3TTJ4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3TTJ4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q3TTJ4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3TTJ4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3TTJ4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3TTJ4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q3TTJ4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3TTJ4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3TTJ4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3TTJ4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q3TTJ4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3TTJ4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3TTJ4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3TTJ4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Q3TTJ4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3TTJ4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q3TTJ4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3TTJ4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3TTJ4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q3TTJ4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3TTJ4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3TTJ4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3TTJ4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q3TTJ4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3TTJ4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3TTJ4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q3TTJ4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3TTJ4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Q3TTJ4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3TTJ4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q3TTJ4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q3TTJ4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3TTJ4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3TTJ4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3TTJ4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q3TTJ4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q3TTJ4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Q3TTJ4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Q3TTJ4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q3TTJ4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q3TTJ4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q3TTJ4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q3TTJ4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q3TTJ4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q3TTJ4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q3TTJ4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q3TTJ4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q3TTJ4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q3TTJ4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q3TTJ4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q3TTJ4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Q3TTJ4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q3TTJ4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q3TTJ4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q3TTJ4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q3TTJ4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q3TTJ4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Q3TTJ4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms