Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fubp3Q3TIX6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fubp3Q3TIX6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fubp3Q3TIX6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fubp3Q3TIX6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fubp3Q3TIX6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fubp3Q3TIX6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fubp3Q3TIX6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Fubp3Q3TIX6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fubp3Q3TIX6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fubp3Q3TIX6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fubp3Q3TIX6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fubp3Q3TIX6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fubp3Q3TIX6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fubp3Q3TIX6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fubp3Q3TIX6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fubp3Q3TIX6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fubp3Q3TIX6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fubp3Q3TIX6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fubp3Q3TIX6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fubp3Q3TIX6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fubp3Q3TIX6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fubp3Q3TIX6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fubp3Q3TIX6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fubp3Q3TIX6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Fubp3Q3TIX6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fubp3Q3TIX6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fubp3Q3TIX6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fubp3Q3TIX6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fubp3Q3TIX6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fubp3Q3TIX6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fubp3Q3TIX6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Fubp3Q3TIX6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fubp3Q3TIX6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fubp3Q3TIX6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fubp3Q3TIX6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fubp3Q3TIX6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fubp3Q3TIX6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fubp3Q3TIX6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fubp3Q3TIX6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fubp3Q3TIX6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fubp3Q3TIX6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fubp3Q3TIX6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fubp3Q3TIX6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fubp3Q3TIX6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fubp3Q3TIX6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fubp3Q3TIX6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fubp3Q3TIX6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fubp3Q3TIX6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fubp3Q3TIX6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fubp3Q3TIX6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fubp3Q3TIX6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fubp3Q3TIX6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fubp3Q3TIX6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fubp3Q3TIX6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fubp3Q3TIX6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fubp3Q3TIX6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fubp3Q3TIX6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fubp3Q3TIX6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fubp3Q3TIX6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fubp3Q3TIX6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fubp3Q3TIX6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fubp3Q3TIX6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fubp3Q3TIX6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Fubp3Q3TIX6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fubp3Q3TIX6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fubp3Q3TIX6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fubp3Q3TIX6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fubp3Q3TIX6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fubp3Q3TIX6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fubp3Q3TIX6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fubp3Q3TIX6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Fubp3Q3TIX6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Fubp3Q3TIX6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fubp3Q3TIX6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fubp3Q3TIX6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fubp3Q3TIX6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fubp3Q3TIX6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fubp3Q3TIX6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fubp3Q3TIX6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fubp3Q3TIX6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fubp3Q3TIX6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fubp3Q3TIX6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fubp3Q3TIX6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fubp3Q3TIX6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fubp3Q3TIX6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fubp3Q3TIX6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fubp3Q3TIX6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fubp3Q3TIX6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fubp3Q3TIX6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fubp3Q3TIX6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fubp3Q3TIX6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fubp3Q3TIX6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fubp3Q3TIX6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fubp3Q3TIX6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fubp3Q3TIX6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Fubp3Q3TIX6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fubp3Q3TIX6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fubp3Q3TIX6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fubp3Q3TIX6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms